經歷了一系列的活動，暑期講座終於接近尾聲，小智三人靜靜地坐在教室中，聆聽著山梨博士最後的演講！ 而小智與小光的精靈蛋則被寄存在了孵化空間手環中！ “最後的課程是暑期講座裡最大的一場活動，神奇寶貝鐵人三項！希望大家活用在這裡學到的跟體驗到的事情，在比賽當中全力以赴！” 規則大概就是從研究所出發，去拿山梨博士準備好的隨機精靈球，和神奇寶貝一起穿越一片森林，來到湖泊後替換成水系神奇寶貝渡過湖泊，然後和自己持有的神奇寶貝一起跑馬拉松返回研究所！ 第一位到達終點的選手會得到50分，第二位則是30分，第三位是20分，第四位到達的選手開始，將會每個人各得10分，然後所獲得的分數總和就是最後的成績！ 規則講清楚後，他們的老師便帶到了一片空曠的草原，藍組與綠組也來到此處，準備進行最後的比拼。 “小智，這次我可不會輸給你的！”小葵用充滿戰意的小眼神盯著小智。 對於挑戰小智自然毫不猶豫的應了下來。 “各位，看來你們已經迫不及待了！”山梨博士也來到此處，看著這些朝氣蓬勃的年輕人一向嚴肅的臉也不禁露出笑容，“現在神奇寶貝鐵人三項即將開始，全體各自就定位！” “預備～” 砰—— 隨著山梨博士的一聲槍響，最後的鐵人三項正式開始，頓時場地一片混亂爭先恐後的上前衝鋒！ “快讓開快讓開！武藏琳達大人要透過了咧！”武藏更是一馬當先第一個抵達第一個據點，讓小智狠狠的震撼了一把，武藏果然深不可測！ “我是第一個到的咧，快出來吧！”武藏此刻直接丟出自己拿到的精靈球，隨即放出了個大傢伙，作為資深的顏控，當即開始大吼大叫，“討厭啦，是河馬獸，退貨退貨！武藏琳達我喜歡更帥氣一點，跑得更快的咧，我要換！” 但卻被工作人員直接拒絕，而小智三人以及小葵已經追了上來，武藏只好放棄討價還價騎上河馬獸鑽入地下就出發了！ 小智他們與武藏相比就麻利多了，拿過一枚精靈球就丟了出去！ “陸鯊！”神奧準神烈咬陸鯊出現在場地，讓小智有些驚訝，沒想到研究所竟然還準備了準神！ 沒有猶豫，小智騎上烈咬陸鯊，笑道，“接下來拜託你了，烈咬陸鯊！” “陸鯊！” 烈咬陸鯊暴吼一聲，然後就向著湖泊飛昇而去，小葵抽中了阿利多斯，利用吐絲在森林中穿梭位居第二！ 第三則是騎著嘟嘟利的小光，然後才是騎著大巖蛇的小剛，當然主要不知道武藏鑽到哪裡去了。 選手們的表現自然被搭乘熱氣球的助手拍了下來，山梨博士對此十分的滿意！ 此刻小智已經率先趕到湖泊，將烈咬陸鯊收了回來，拿到第二枚精靈球立刻丟出！ “是巨翅飛魚啊！”小智點點頭，然後搭上巨翅飛魚滑翔而去，要知道小智可是滄海之王，巨翅飛魚對小智自然十分親切，這下更加賣力的上前衝鋒！ 而小葵十分幸運的抽到了乘龍，同時藉助急凍光線直接在湖面上快速滑行！ 小光與小剛則被考平用浮潛鼬超越，接著又被武藏與憤怒的鯉魚王超越！ 兩人最終與小葵一起共同抵達第三個據點，而此刻小智已經帶著皮卡丘與伊布同時出發了！ 三人連忙將水系神奇寶貝歸還，和自己的神奇寶貝開始了最後的馬拉松之旅！ —————————— 最後不出意外的，小智拿到了最後的第一名，而小葵則是第二名，讓小智意外的是小光竟然是第三名！ 而考平與武藏卻因為體力不支拿到了倒一與倒二，這下前三被紅組包圓了，以絕對的優勢拿下了第一名！ 講座圓滿結束，山梨博士為每個學員頒發了一個紀念證書，當天晚上更是舉行了篝火晚會，伙食更是十分豐富！ 少年少女也開始了互相道別，畢竟下次見面還不知道是什麼時候呢？ 這七天小智三人收穫頗豐，尤其是小智與小光闖蕩靈界，一人得到了一枚精靈蛋！ 翌日，少年少女們紛紛與山梨博士告別，分別踏上了他們各自的旅程，而小智三人也與小葵約定重返隨意鎮時，