佛指過去佛燃燈古佛，現在釋迦牟尼佛和未來佛彌勒佛。

密宗尊五方佛，為中央大日如來，東方不動如來，南方寶生如來，西方阿彌陀佛，北方不空成就佛。

禪宗則尊以大悲觀世音菩薩為首的眾多佛母。

而萬佛殿正是古佛宗佛法傳承之地，內建諸天眾佛、菩薩、羅漢、金剛佛像，共計萬餘座。因此萬佛殿即為佛門重地，同時也是傳承領域。在此殿誠心禮佛之人，可獲眾佛認可，傳承某一佛祖的神通佛法。非立大功勞者不可進入。

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