永曆帝前往昆明。

八、兵敗降清

公元1657年（永曆十一年、順治十四年）八月，孫可望親自率領十萬大軍從貴陽向駐紮在雲南的大西軍二號人物李定國發動進攻。當時，李定國與劉文秀的聯軍只有三萬人，雙方力量對比極為懸殊。面對強敵，李定國採取了誘敵深入的戰略，使孫可望的部隊一路未遇到任何抵抗，輕鬆地推進到了雲南曲靖附近的交水河畔。此時，李定國和劉文秀的軍隊已經在河對岸布好了陣勢，準備以逸待勞。

當孫可望的部隊試圖強行渡河時，雙方展開了激烈的戰鬥。不久之後，劉文秀的驍將崇信伯李本高在戰鬥中戰死，導致前鋒受挫。孫可望站在高地上觀戰，看到李定國的軍隊氣勢受挫，便命令各營乘勝前進。然而，孫軍後陣的白文選見李、劉兩軍處於不利局面，親自率所部五千鐵騎從後方衝向孫可望的軍隊。同時，孫可望的部將馬唯興也臨陣倒戈，與白文選聯合從孫可望的陣後發動突襲，接連攻破多個營地。許多孫軍士兵脫下號衣，跪地高喊“迎晉王”，導致孫軍陣腳大亂。看到大勢已去，孫可望不敢戀戰，立即撤退，最終十萬大軍只剩下了五十多名騎兵跟隨他逃走。

戰敗後的孫可望本可以選擇與李定國重歸於好，聯手抗清，或者承認失敗，退出軍政舞臺，隱居以終。然而，孫可望未能壓制住心中的怒火，選擇跑到長沙投降清朝，希望藉助清軍的力量來複仇。

公元1658年（永曆十二年、順治十五年）二月，孫可望在長沙接受了清朝的冊封典禮，隨後被召進京見駕。五月二日，孫可望抵達北京。清廷派出了和碩簡親王濟度、和碩安親王嶽樂等大批高官顯爵出城迎接，場面相當隆重。第二天，順治帝親自在太和殿接見了孫可望，並在十天之內三次設宴款待，兩次賜銀共計一萬二千兩，另外還賜給他府第、解袍、朝衣、緞匹等。孫可望因此成為了清廷中備受寵愛的人物。

然而，孫可望降清的行為出賣了西南抗清武裝的情報，導致李定國及其部下的抗清事業最終失敗。清廷封孫可望為義王。

同年七月，孫可望得知失散多年的弟弟孫可升在上海的訊息，非常高興。他立即向清廷提出申請，要求使用官方的驛站系統將自己的弟弟一家接到北京團聚。這一請求卻招致了清廷御史的猛烈抨擊。御史們指出，孫可望最初作為張獻忠的養子，在蜀楚地區製造了大量破壞，引起了人們的公憤。之後，他又起兵反抗清朝，直到眾叛親離、無計可施之時，才率領數百疲憊計程車兵來歸順清朝。御史們還認為，孫可望的弟弟僅僅是一名普通計程車兵，沒有官職，沒有資格使用官方驛站。

面對御史的批評，孫可望感到非常震驚，急忙上疏謝罪，以求挽回局面。

九、兔死狗烹

公元1659年（永曆十三年、順治十六年）閏三月，有人揭發孫可望放債取利等事。順治皇帝雖然知道這種現象在滿洲八旗中是常見的，但他還是抓住了這個機會來進一步貶損孫可望的政治地位。順治帝派遣內閣學士馬邇吉來到孫可望的住所宣讀諭旨，先是嚴厲訓斥，然後宣佈寬恕其罪。在這樣的驚恐之下，孫可望連忙上奏解釋自己的行為，並向順治皇帝搖尾乞憐。自此之後，孫可望的處境變得更加尷尬，正如古語所說“神龍失勢，與蚯蚓同”。

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公元1660年（永曆十四年、順治十七年）六月，孫可望被迫上疏請求辭去義王封爵和冊印。此時，南明永曆帝雖然已經逃入緬甸，西南大局已定，但以李定國為首的明軍殘部仍在邊境地區堅持鬥爭。清廷認為此時撤掉孫可望虛有其名的義王封號不符合當時的策略，因此順治帝特意釋出了一道措辭講究的聖旨，維持孫可望的封號。

同年11月20日，孫可望去世。官方的說法是他因病去世，但真相存在疑