七十歲以上的老人獻米以補充軍需，這一政策加劇了民眾的不滿，導致大量百姓逃離，社會輿論一片譁然。

面對如此困境，崔瑩深感委屈和無奈。洪武七年（1374年）三月，他被調任為慶尚、楊廣、全羅都巡問使。然而，司憲府很快便彈劾他在六道都巡察使任內的不當行為，認為這些舉措引發了民心騷動，不適合繼續擔任巡問使。面對這一指控，崔瑩悲憤交加，向恭愍王哭訴道：“臣赤膽忠心報效國家，如今卻遭受如此不公的誹謗，請陛下罷免臣的官職！”恭愍王瞭解崔瑩的忠誠和才能，雖然同意了司憲府的部分建議，讓其他官員擔任三道都巡問使，但同時也罷黜了彈劾崔瑩的大司憲金續命等人，並賜予崔瑩“盡忠奮義宣威佐命定亂功臣”的榮譽稱號，以表彰他的功績和忠誠。

四、伐濟御倭

洪武七年（1374年）七月，崔瑩迎來了人生中的一個重要轉折點。當時，高麗的濟州島被蒙古人（稱為“牧胡”）控制，這些人主要在島上放牧。為了利用明太祖向高麗索取馬匹的機會，恭愍王決定收復濟州島。崔瑩被任命為慶尚、楊廣、全羅都統使，率領314艘戰艦和名士兵南征。這次軍事行動規模龐大，顯示了高麗政府收復失地的決心。崔瑩在明月浦登陸後，迅速與牧胡的三千餘騎兵展開了激戰。經過一番艱苦的戰鬥，崔瑩最終於八月下旬平定了濟州島，斬殺了牧胡首領石迭裡必思等人，並將首級傳送到開京，同時繳獲了一千匹馬。十月，崔瑩班師回朝，但在抵達開京時，恭愍王已經遇害，其子王禑繼位。崔瑩在恭愍王的靈柩前覆命，痛哭失聲，表達了對舊主的深切哀悼。

崔瑩的南征雖然取得了勝利，但也引發了一些爭議。王禑認為，如果崔瑩沒有率軍南征，恭愍王或許不會遇害。儘管如此，崔瑩的軍事才能仍然得到了認可。洪武八年（1375年），崔瑩被任命為判三司事，與慶復興（慶千興）、李仁任、池奫等重臣共同輔佐年幼的王禑。與此同時，他還要與李成桂一起領兵防備倭寇的侵擾。

洪武九年（1376年）七月，倭寇在連山開泰寺擊敗高麗軍，元帥樸仁桂戰死。得知這一訊息後，崔瑩主動請纓出戰。儘管王禑擔心崔瑩年過六十，身體狀況不適合領兵，但崔瑩表示：“小小的倭寇如此橫行霸道，現在不制伏，以後必然難以控制。如果派其他將領，未必能贏，而且士兵不上戰場試試身手，也不能用。臣雖然年老，但志氣不衰，只是想安定宗社、保衛王室，願馬上率麾下將士去擊退他們！”在崔瑩的再三請求下，王禑終於同意了他的請求。崔瑩當天就出發，不久在楊廣道鴻山（今韓國忠清南道扶余郡鴻山面）遭遇倭寇。他先佔據有利地形，然後身先士卒，與倭寇激戰。即使嘴唇中箭，崔瑩也神色自若，最終力克倭寇，於八月凱旋開京。王禑打算任命崔瑩為百官之首——門下侍中，但崔瑩表示一旦當上侍中，就不能掛帥出征，希望等到倭寇平息後再考慮。於是，王禑封他為鐵原府院君，以表彰他的功績。

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宣光七年（1377年，洪武十年）春，高麗朝廷內部發生了一場政治鬥爭。李仁任與池奫之間的矛盾日益激化，最終導致池奫被誅殺。崔瑩站在李仁任一邊，參與了這場政變。事後，崔瑩感到非常慚愧，便以年老多病為由請求辭職，但王禑沒有同意。同年，倭寇再次騷擾江華島一帶，崔瑩以都統使的身份坐鎮昇天府（今朝鮮黃海北道開豐郡），負責防禦倭寇。他與邊安烈聯手擊退了入侵西江的倭船，再次證明了自己的軍事才能。王禑曾考慮將首都遷至內地以避開倭寇的侵擾，但遭到崔瑩的反對，最終放棄了這一計劃。同年九月，崔瑩又成功擊退了入侵海、平兩州的倭寇。

宣光八年（1378年）四月，倭寇再次大舉入侵，船隻雲集窄梁，攻入昇天府