王進寶為陝西提督，駐秦州。甲午，以建儲恭上太皇太后、皇太后徽號。乙未，升寧夏總兵官為提督，以趙良棟為之。辛丑，上幸南苑行圍。

二月丁巳，詔軍中克城禁殺掠。壬戌，命大學士圖海為撫遠大將軍，統轄全秦，自貝勒洞鄂以下鹹受節制。癸酉，上如鞏華城，諭扈從勿踐春田。乙亥，吳三桂將高大傑陷吉安。戊寅，安親王嶽樂擊三桂將於萍鄉，敗之，復萍鄉。辛巳，上御經筵。贈死事副將張國彥太子太保，予世職。

三月癸未，贈海澄公黃芳度郡王。丙戌，王進寶、佛尼勒大敗吳之茂於北山。庚寅，傅喇塔圍溫州，曾養性、祖弘勳悉眾來犯，副都統紀爾他布擊走之。辛卯，嶽州水師克君山。庚子，勒爾錦渡江與三桂之眾戰，迭敗之。乙巳，賜彭定求等二百九人進士及第出身有差。己酉，勒爾錦與三桂之眾戰於太平街，不利，退守荊州。壬子，移趙賴提督江西。

夏四月辛丑，馬雄、祖澤清糾滇賊犯廣東。尚可喜老病不能軍，屢疏告急，援兵不時至。至是，賊逼廣州，尚之信劫其父以降賊。總督金光祖，巡撫佟養鉅、陳洪明，提督嚴自明俱從降。福建巡撫楊熙、總兵拜音達奪門出。舒恕、莽依圖退至江西。上聞廣東變作，命移兵益江西。

五月壬午朔，日有食之。乙酉，復設鄖陽撫治，以楊茂勳任之。丙戌，鄂羅斯察漢汗使人來貢。己亥，撫遠大將軍圖海敗王輔臣於平涼。

六月壬子朔，王輔臣降，圖海以聞。詔復其官，授靖寇將軍，立功自效，諸將弁皆原之。己卯，耿繼善棄建昌遁。上諭傑書曰：“耿精忠自撤其兵，顯為海寇所逼。其乘機速進。”

七月辛巳朔，賜鄂羅斯使臣鞍馬服物。大學士熊賜履免。以慕天顏為江蘇巡撫。庚子，以姚文然為刑部尚書，郎廷相為福建總督。振武將軍佛尼勒會張勇、王進寶擊吳之茂於秦州，大敗之，賊眾宵遁。

八月甲寅，穆佔復禮縣。壬戌，上奉太皇太后幸湯泉。乙亥，賴塔擊馬九玉於衢州，復江山，九玉棄軍遁。

九月庚辰朔，賴塔進擊馬九玉，破之，復常山。進攻仙霞關，賊將金應虎迎降，復浦城，連下建寧。癸未，張勇復階州。乙未，耿精忠戕前總督範承謨。山西巡撫達爾布有罪免。丙午，命穆佔為徵南將軍，移軍湖廣。

冬十月辛酉，上奉太皇太后還宮。乙丑，康親王傑書師次延平，賊將耿繼美以城降。耿精忠遣子顯祚獻偽印乞降，傑書入福州，疏聞。上命復其爵，從徵海寇自效。其將曾養性、叛將祖弘勳俱降。浙江官兵復溫、處二府。撤兗州屯兵。癸酉，命講官進講通鑑。

十一月丙戌，海寇犯福州，都統喇哈達擊敗之。丙申，官兵圍長沙。寧海將軍貝子傅拉塔卒于軍。

十二月壬子，遣耿昭忠為鎮平將軍，駐福州，分統靖南籓軍。叛將嚴自明犯南康，舒恕擊走之。丁巳，尚之信使人詣簡親王軍前乞降，且乞師，疏聞。許之。吳三桂將吳世琮殺孫延齡，踞桂林。庚申，海澄公黃芳世自賊中脫歸。上嘉之，加太子太保，與其弟黃藍並赴康親王大軍討賊。建威將軍吳丹復山陽。辛未，頒賞諸軍軍士金帛。丙子，祫祭太廟。耿繼善棄邵武，海寇據之。副都統穆赫林擊之，賊將彭世勳以城降。

是歲，免直隸、江南、江西、陝西各省三十四州縣災賦有差。朝鮮入貢。

十六年丁巳春正月丙申，將軍額楚攻吉安失利，命侍郎班迪馳勘軍狀。

二月己未，上幸南苑行圍。甲子，大閱於南苑。免福建今年租賦，招集流亡。丙寅，以鄂內為討逆將軍，赴嶽州。丁卯，康親王傑書敗鄭錦於興、泉，賊棄漳州遁，復海澄。遣郎中色度勞軍嶽州，察軍狀。辛未，以靳輔為河道總督。癸酉，論花馬