至在孝宗去世後拒絕主持喪禮，引發了朝野震動與強烈不滿。在這樣的複雜政治背景下，趙惇迫於形勢，選擇了退位，將皇位傳給了次子趙擴，也就是後來的宋寧宗。

這一舉動非但折射出趙惇個人內心的苦楚與無奈，也體現出當時南宋朝廷內部矛盾尖銳、皇權交接面臨空前挑戰的嚴峻態勢。趙惇退位後，儘管名義上成為太上皇，但實則逐漸遠離了權力中心，直至慶元六年八月辛卯日（1200年9月17日），趙惇逝世於壽康宮，結束了他短暫而又充滿波折的一生，享年五十四歲。

趙惇去世後，朝廷給予了他較高的評價，初諡“憲仁聖哲慈孝皇帝”，廟號光宗，彰顯其在位期間理論上應具備的道德品質和治國理念。後又追加諡號至“循道憲仁明功茂德溫文順武聖哲慈孝皇帝”，此諡號包含了諸多讚譽之辭，試圖全面概括其一生的功過是非，儘管事實上，趙惇在位時的政績和聲譽並不盡如人意。

五、政治遺產與歷史評價

趙惇在位期間，開啟了“一相去臺諫以黨去，一相拜臺諫以党進”的先例，這種現象導致了相權與臺諫之間形成結黨營私、互相勾結的局面，這不僅反映出南宋晚期政治生態的複雜性，也在一定程度上預示了後續朝政的動盪。趙惇的一生，既有初登大寶時銳意改革的意願，也有面對現實困境時對權力制約機制的收縮，他的統治經歷無疑為後世研究南宋政治變遷提供了重要的歷史參考。