佑擔任雲貴總督後，他的首要任務之一便是建設和發展雲南 練 軍 ，這是為了增強邊境防禦能力，防止外部勢力的入侵。為此，他引入了一批曾在楚勇中表現出色的骨幹力量，以此為基礎對雲南軍隊進行了徹底的改編。同時，他還積極引進當時中國較為先進的武器裝備，極大地提升了雲南 練 軍 的整體戰鬥力。透過這些舉措，劉長佑不僅增強了地方武裝的力量，也為日後可能發生的衝突做好了準備。

面對英法兩國日益增長的侵略野心，劉長佑表現出了高度的警惕性。他認為，如果允許外國勢力輕易進入雲南或越南北部，那麼將對中國南部邊疆構成嚴重威脅。因此，他提出了多項應對策略，其中之一就是在越南境內長期駐紮軍隊，以此來遏制法國對北圻地區的擴張企圖。劉長佑認為這種做法既可以作為防範措施，也可以作為一種威懾手段，阻止敵人的進一步行動。然而，由於法國方面不斷施壓，要求中國撤出所有駐越部隊，這一建議並未得到充分實施。

除此之外，針對英國和法國想要開採雲南豐富礦產資源的想法，劉長佑也表達了強烈的反對態度。他主張應該由中國人自己或者聘請熟悉西方技術的專業人士來進行開發，這樣既能保護國家利益不受侵害，又能有效防止外人插手內部事務。儘管如此，他的許多提議並沒有獲得清政府的廣泛支援。

隨著法國殖民者加緊對越南的控制，並且開始策劃更大規模的軍事行動，中法之間的緊張關係逐漸升級。特別是當法國將軍李威利率領大軍入侵北圻時，形勢變得尤為嚴峻。面對這樣的挑戰，劉長佑迅速採取了一系列應對措施。他一方面緊急向朝廷上書請求增援，另一方面則積極籌措物資，如馬匹、盔甲等，全力支援已經在越南作戰的劉永福及其他將領。最終，在得到中央政府批准的情況下，劉長佑親自指揮大軍跨過國境，深入越南腹地，正式開啟了中法戰爭的序幕。

五、病逝原籍

光緒九年（1883年）六月，劉長佑因健康原因辭去了所有官職，返回湖南新寧老家休養。儘管離開了政治舞臺，但劉長佑對國家大事的關心從未減少。在家鄉的日子裡，他仍然透過各種渠道關注著時局的變化，並且時常向舊友和同僚表達自己對於國事的看法與建議，展現了“忠悃始終如一”的高尚情操。

經過數年的靜養，劉長佑的身體狀況並未見明顯好轉。光緒十三年（1887年）六月二十五日卯時，這位曾為清朝立下赫赫戰功的老將在家中病逝，享年七十歲。訊息傳開後，朝野上下無不感到惋惜。湖南巡撫卞寶第代為向清廷上奏了劉長佑的遺疏，詳細報告了他的生平事蹟及最後的願望。

光緒帝得知這一訊息後，深感悲痛，隨即釋出上諭表示哀悼，並宣佈按照總督級別的標準給予優厚的撫卹待遇。此外，皇帝還特別指示，劉長佑在職期間所受到的一切處分均予以撤銷，以表彰其一生的忠誠與貢獻。根據諡法中關於“武”和“慎”的定義——即“折衝禦侮曰武，剛強以順曰武；小心克勤曰慎，夙夜敬畏曰慎”，朝廷賜予劉長佑“武慎”的諡號。