，一邊派總督府的官吏給災民們兩個選擇，第一個選擇是去剛剛被佔領的馬六甲港，那裡有現成的房屋和田地，唯一的缺點就是有些遠，第二個選擇則是去臺灣島，那裡雖然有不少漢人居住，但更多的地方都是密林，若是移民去那裡的話，雖然可以分到更多的田地，但卻需要靠自己的雙手開荒和建造房屋，而且臺灣距離大明也更近，不必再乘船奔波萬里。

對於臺灣的開發，周重早就想做了，畢竟這座面積廣闊的島嶼資源豐富，而且氣候十分適合耕種，再加上距離大陸又近，島上早就有不少漢人居住，唯一缺的就是大明對這裡的管轄，現在自己手中有權，而且又要遷移災民，所以周重就直接把臺灣島划進自己的治理地區，同時也打算遷移一部分災民充實臺灣的人口。

不過周重顯然低估了大明百姓的鄉土情結。以及他們對大海的恐懼。特別是許多災民在上了船後發生了暈船。結果每天都有人吐的痛不欲生，後來雖然好了一些，但對海洋的恐懼已經深深的印在他們的心裡。

也正是因為上面的原因，所以這些災民在聽到可以選擇留在離大明比較近的臺灣島時，立刻有一大半的人選擇了去那裡，沒有現成的田地和房子算什麼，只要有口吃的，家中又有勞力。田地可以開荒，房子可以重新蓋，而且聽說那裡全是樹林，木頭根本不要錢，有這些現成的材料，蓋個房子根本不是什麼事。

所以最後經常總督衙門的統治，這次遷移的三十一萬六千多百姓，最後選擇去臺灣的就有二十三萬人，選擇去馬六甲的人卻還不到十萬，由此可知這些災民是如何的眷戀故土。用他們的話講，臺灣畢竟在大明旁邊。等到他們死了，還能讓子孫們把自己運到老家埋到祖墳裡，但若是去了南洋，那可是一輩子都別想回來了。

對於災民們的選擇，周重雖然有些遺憾，但卻尊重他們的選擇，二十多萬人全都被送到臺灣，分成十幾部分定居在臺灣島各處，那些島上原來居住的漢人也被重新歸入大明的管轄，幫助官府安置那些災民，至於糧食也很好解決，占城和呂宋都是南洋的產糧地，價格十分低廉，派船去買就是了。

安排好去臺灣移民後，剩下的近十萬去馬六甲的移民也很快重新上船，這些移民之所以選擇去馬六甲，原因多種多樣，有些是因為家中勞力少，開荒建房很是吃力，所以還不如去馬六甲港，也有些是屬於膽大心細，從各方面打聽到馬六甲的富饒，所以決定去碰下運氣，更有些人是不想再從土裡刨食，聽說馬六甲那邊要開建各種作坊，需要大量的人手，雖然原因各不相同，不過只要他們願意去馬六甲，周重就十分高興，畢竟那裡才是近期開發的重點。

周重在雙嶼港一邊休息一邊處理移民的事，雙嶼港現在不但是海上的交易中心，同時也是他這個四海總督的治所，也就是政治中心，總督衙門也已經建造好了，平時周重就在這裡辦公，所有政令都是出自這裡。

移民的事馬虎不得，周重已經將這件事做為總督衙門的第一要務處理，總督府的幾乎所有官吏都在圍繞著這件事辦公，畢竟光是遷移還不行，這些移民遷移到臺灣和馬六甲港後的生活也是他們需要考慮的，糧食僅僅是一方面，田地和耕種所需也是他們必須要考慮的，否則一個不好就可能引發大亂子。

周重每天早出晚歸，幾乎是泡在總督衙門辦公，剛開始時他還有些不適應，畢竟之前他只是提督，管理的事情大都是軍務，不像政務這麼繁雜，可是現在要考慮幾十萬災民的吃穿用度，以及各地的開發規劃