當然，其時也有不少專家學者對此提出了自己的擔憂。畢竟在和平和發展的大背景下，中方的這一舉動，必將讓原本就緊張的中日關係更加惡化，不利於中日交流和社會經濟發展，甚至有可能將中國拖入戰爭的泥沼之中。這不是一種明智的行為，而呼籲中方應該停止這種危險地行為，應該回歸到原點，從發展中日關係出發，將釣魚島問題留待以後解決。不過這些說辭在鋪天蓋地的讚譽和興奮之中，顯得那麼地微不足道，不是被憤青們罵作是“投降派”，就是很快就被大家激昂的情緒所淹沒。

而與此同時，日本卻頓時陷入了混亂之中。習慣了中國政府抗議的日本民眾都不敢相信，中國政府居然會做出這樣強硬和損害日本國家利益的事情來。一直以來，中國政府不都聲稱從發展中日關係出發，將釣魚島問題留待以後解決，不採取單方面行動嗎？這怎麼突然又將尖閣諸島擅自交由飛遠公司開發呢？

日本民眾一時間都有了上當受騙的感覺，卻渾然忘記了，一直以來，都是日方不斷地在釣魚島問題上挑起事端，頓時是群起激憤。在政府還未作出官方決策之前，民間情緒日益高漲，當天就有數百人到中國駐日大使館外舉行了小規模的抗議。

同時，日本右翼分子更是以此為契機，大肆在國內掀起**活動，不少在日華人的商店遭到哄搶砸損，華人學校被投擲石塊，網站被日駭客攻擊，還公然在中國駐日大使館外焚燒中國國旗。個別地區，在日華人的人身安全受到了威脅，出現了個別的襲擊、綁架事件，正常生活遭受到了極大的干擾和威脅。

中國外交部和駐日大使館啟動了應急機制，並提醒中國公民在海外留意身邊的安全狀況，提高防範意識，確保安全。

經過緊急磋商之後，日本首相和內閣首先暫時說服了防衛廳長官暫時不要輕舉妄動。隨即採取行動，一方面連忙安撫國內民眾的情緒，防止事態嚴重和擴大，並被反對黨利用。同時，向中國政府發出了照會，嚴重抗議中方擅自單方面將存在爭議的尖閣諸島交由飛遠公司開發，要求中方立刻停止這種非法行為，否則由此引起的一切後果均有中方承擔。

口氣極為嚴厲。

中方外交部發言人當即回應，釣魚島群島自古以來就是中國的領土，它和臺灣一樣是中國領土不可分割的一部分。中國對釣魚諸島及其附近海域擁有無可爭辯的主權。對於釣魚島群島所進行的任何舉措，都是中國的內政，無須得到日方的同意。並對日方一直以為在釣魚島群島海域的“非法”行為提出嚴重抗議，聲稱中方將不惜一切代價保衛國家主權和領土完整，希望日方能夠懸崖勒馬，不要再執迷不悟。

中方一反常態的強硬態度當即就激怒了日方。日本立刻宣佈無限期停止中日雙邊合作會談和經濟往來，中止任何官方形式的合作交流，並視情況而定，保留隨時召喚駐華使節，關閉大使館的權力。同時，日方也積極和飛遠公司進行聯絡磋商，希望飛遠公司能夠停止和中方的“非法”合作，而日方也願意在此上面和飛遠公司進行廣泛深入的合作，日方提供的條件，絕不會遜色於中方。換句話來說，也就是給飛遠吃了一顆定心丸，無論如何，也不會損害飛遠公司在這方面的利益。

不過不論是中方，還是飛遠公司，都對於日方的要求給予了堅決地回絕。中方聲稱，領土問題絕不妥協。而飛遠則是明確表示，飛遠公司一貫都承認釣魚島群島是中國領土的一部分，並支援中方行使主權。而且飛遠公司的正常商業行為不受日方的干涉。同時，飛遠公司還向日方提出了嚴重抗議，聲稱日方十餘艘軍艦在釣魚島海域活動，軍機頻繁在釣魚島附近海域飛行，嚴重影響到了飛遠公司的正常作業。如若不立即停止，飛遠公司將保留包括武力在內的一切維護其正常生產秩序的必要手段。

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