。到了秋天，部分太平軍從下游分竄至河南，經由羅山進入了湖北的黃安和麻城境內。張亮基隨即指揮水陸兩路的軍隊對這些叛軍進行了夾擊，最終將其消滅。

三、督防山東

在調任山東巡撫之前，張亮基正面臨一場新的挑戰。當時，江西的叛軍從九江出發，試圖侵犯山東。尚未正式履新山東巡撫的張亮基，面臨著江西叛軍的威脅。他命令道員徐豐玉在田家鎮抵禦叛軍，然而在戰鬥中，徐豐玉不幸陣亡，這次戰鬥的失利使得張亮基受到了牽連，被降級留任。

同一時期，廣東地區的叛軍頭目李開芳等人開始侵擾京城周邊區域，並佔據了靜海。張亮基此時已經正式上任為山東巡撫，根據朝廷的命令，他負責在德州一帶部署防線，以防止叛軍向南逃逸。同時，南部的叛軍企圖透過淮河流域和徐州一帶向北進犯，以策應北方的叛軍。為此，張亮基命令按察使厲恩官率領部隊駐紮在宿遷北部，以防止叛軍的北進。

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到了咸豐四年（1854年），叛軍終於突破防線進入了山東境內。張亮基迅速反應，親自前往濟寧指揮防守，力圖阻止叛軍繼續北上。儘管在濟寧成功遏制了叛軍的前進，但叛軍還是攻陷了鄆城，並繼續擾亂範縣、壽張、東平等地。面對這種情況，張亮基調整策略，採取迂迴戰術，在叛軍前方截擊，最終在臨清黑家莊擊敗了叛軍，取得了勝利。

然而，正當張亮基準備慶祝這場勝利之時，卻遭遇了來自幫辦軍務大臣勝保的指控。勝保指責張亮基在臨清之戰中取巧冒功，並上奏朝廷。結果，張亮基不僅沒有得到應有的表彰，反而被朝廷嚴厲批評，稱其欺騙朝廷，並追溯到他最初前往湖南時不急於解長沙之圍以及離開湖北時只求自身安全，認為其心思狡猾。因此，張亮基被剝奪了職務，並被流放至軍臺服役。

幸運的是，經過一段時間後，有人為張亮基辯護。給 事 中毛鴻賓指出，在臨清之戰中，勝保的指控是錯誤的。御史宗稷辰也認為張亮基能夠勝任重任，卻沒有得到應有的使用機會。於是，朝廷重新評估了張亮基的案件，決定釋放他，並任命他到東河從事差遣工作，不久之後又被派往安徽參與軍務處理。

四、鎮壓回匪

咸豐七年，清政府面臨雲南回民起義的嚴峻挑戰，任命某位官員（文中未具體指明姓名，以“予五品頂戴”代稱）協助處理剿匪事務。此時，雲南的回民起義勢力正盛，省會昆明地區更是團練勢力橫行。新任總督吳振棫抵達曲靖後，採取措施限制團練的權力，並嘗試招撫回民起義軍。

沾益地區的回民起義軍尤為強悍，他們集結力量攻打宣威，但被按察使徐之銘等人率軍擊退。咸豐八年春天，起義軍又在袁家屯遭遇重創，大量叛匪被殲，殘餘勢力選擇接受招撫。朝廷對此表示嘉獎，並任命吳振棫為雲南巡撫。然而，吳振棫不久便請求離職，隨後該官員被提拔為雲貴總督，並推薦徐之銘接任巡撫一職。

在徐之銘擔任巡撫期間，臨安地區的回民起義軍又發起攻勢，攻佔了阿迷等地，但最終被平定。到了咸豐九年，雖然部分回民起義軍已經接受招撫，但他們又在碧雞關一帶集結，搶劫近郊地區。政府軍分頭圍剿，最終將其驅散。此外，政府軍還平定了平彝、安寧、緬寧、楚雄等地的叛亂，武定、羅次、富民、祿豐、祿勸等州縣也先後收復。

然而，回民與團練之間互相猜忌，衝突不斷。徐之銘上任後，他的貪婪與狠毒逐漸顯露，與總督亮基關係不和，時常在兩人之間製造矛盾。咸豐十年秋天，回民領袖馬德新、徐元吉以及武人馬現等人率領各地回民來到省會昆明乞求招撫，並住在城外的江右館。亮基約徐之銘一同前往安撫，但徐之銘卻暗中唆使已經解散的團練練丁前往總督署阻撓。衝突中，通海知縣雷焱被殺於總督署門前，隨後