都出來迎接，只有李儒因病在家，不能出來迎接。董卓進入相府後，呂布前來祝賀。董卓說：“我登上皇位後，你將總督天下兵馬。”呂布拜謝後，在帳前歇宿。

是夜，有十幾個小孩在郊外唱歌，風吹著歌聲飄入帳中。他們唱道：“千里草，何青青！十日上，不得生！”歌聲非常悲切。董卓問李肅：“這童謠預示著什麼吉凶？”李肅回答說：“這只是說劉氏將滅，董氏將興的意思。”

第二天一早，董卓擺列儀仗入朝。他忽然看見一個道人，穿著青袍白巾，手執長竿，竿上縛著一丈長的布，兩頭各寫一個“口”字。董卓問李肅：“這個道人是什麼意思？”李肅回答說：“他是個心病患者。”於是呼叫將士把他驅趕走。

董卓進入朝廷時，群臣都穿著朝服，在道路上迎接他。李肅手執寶劍扶著車走。到北掖門時，軍兵都被擋在門外，只有御車二十餘人同入。董卓遠遠看見王允等人各執寶劍站在殿門，驚恐地問李肅：“他們持劍是什麼意思？”李肅沒有回答，直接推車進入。王允大聲呼喊：“反賊來了，武士何在？”兩旁轉出百餘人，持戟挺槊刺向董卓。董卓身穿鎧甲，沒有被刺入，但傷了手臂，從車上摔下來。他大呼：“我的兒子奉先在哪裡？”呂布從車後厲聲而出，說：“有詔討賊！”他一戟直透董卓的咽喉，李肅早已經把董卓的頭割下來在手。呂布左手持戟，右手從懷中取出詔書，大聲呼喊：“奉詔討賊臣董卓，其他人不問！”將吏們都高呼萬歲。

後來有人寫詩嘆息董卓說：伯業成時為帝王，不成且作富家郎。誰知天意無私曲，郿塢方成已滅亡。當時呂布大聲呼喊：“助卓為虐的人，都是李儒！誰可以擒住他？”李肅應聲願意去。突然聽到朝門外有人喊叫，報告說李儒的家奴已經把李儒綁縛來獻。王允命令把李儒綁到市曹斬首，又將董卓的屍首在通衢上示眾。董卓的屍體很肥胖，看屍的軍士在他的肚臍中放火作為燈，膏油流滿地。百姓經過時，都用手擲他的頭，用腳踐踏他的屍體。王允又命令呂布同皇甫嵩、李肅領兵五萬到郿塢去抄沒董卓的家產和人口。

而李傕、郭汜、張濟、樊稠聽說董卓已死呂布將至便引了飛熊軍連夜奔涼州去了。呂布到達郿塢後首先取得了貂蟬。皇甫嵩命令將塢中所藏的良家子女全部釋放但凡是董卓的親屬不分老幼都一律誅殺卓母也被殺。董卓的弟弟董旻、侄子董璜都被斬首示眾。他們查抄了塢中所蓄的財物包括黃金數十萬白金數百萬綺羅、珠寶、器皿、糧食不計其數。回報給王允後允於是大犒勞軍士在都堂設宴召集眾官舉杯慶祝。

正在飲酒慶祝的時候忽然有人報告說：“董卓的屍體被暴曬在市場上忽然有一個人伏在他的屍體上大哭。”王允憤怒地說：“董卓被殺士民都拍手稱快。這個人是誰？竟敢獨自為他哭泣！”於是叫來武士：“去給我把他抓來！”不一會兒那個人就被抓到了。眾官一看都驚駭不已原來那個人不是別人正是侍中蔡邕。王允斥責他說：“董卓這個大逆不道的賊人今天被殺是國家的大幸事。你也是漢臣不為國家慶祝反而為賊人哭泣是為什麼？”蔡邕認罪說：“我雖然沒有什麼才能但也知道大義所在豈肯背叛國家而向著董卓？只是因為他一時賞識我知遇之恩所以不覺為他哭泣。我知道自己罪大惡極希望您能原諒我。如果能讓我繼續寫漢史來贖我的罪過我就心滿意足了。”眾官都愛惜蔡邕的才華都竭力為他求情。太傅馬日磾也私下對王允說：“蔡邕是曠世奇才如果讓他繼續寫漢史確實是件大好事。而且他一向以孝行著稱如果倉促殺了他恐怕會失去人心。”

王允說：“過去孝武皇帝沒有殺司馬遷，後來讓他寫史書，結果導致誹謗之書流傳後世。現在國家運勢衰微，朝政錯亂，不能讓奸臣在幼主身邊執筆，讓我們受到他們的嘲諷和非議。”馬日磾無言以對，只好退去。他私下對眾官說：