李傕和郭汜這兩個叛賊原本打算殺掉獻帝，但張濟和樊稠卻勸阻他們說：“不可。如果現在就殺了他，恐怕會引起眾人的反感。不如仍然尊奉他為主公，誘騙其他諸侯入關，先削弱他們的力量，然後再找機會殺他，這樣天下就可以圖謀了。”李傕和郭汜聽從了他們的建議，於是暫時按下了殺機。

獻帝在樓上宣佈諭旨：“既然王允已經被殺，你們為什麼還不退兵？”李傕和郭汜回答說：“我們為皇室立下了功勞，但還沒有得到封賞，所以不敢輕易退兵。”獻帝問：“你們想要封什麼爵位？”於是李傕、郭汜、張濟和樊稠四人各自寫下了自己期望的職位，並強迫獻帝接受。獻帝無奈，只得封他們為將軍和侯爵，讓他們共同執掌朝政。其他如李蒙、王方等人，也都得到了校尉的職位。然後他們謝恩，領兵退出了長安城。

之後，他們又下令尋找董卓的屍體，只找到了一些零碎的皮骨。於是他們用香木雕刻成董卓的形體，進行了安葬。然而，在安葬的過程中，天降大雷雨，平地水深數尺，雷電劈開了棺材，將董卓的屍體提了出來。李傕等天晴後再葬，但當晚又發生了同樣的事情。經過三次改葬，都未能成功，董卓的零皮碎骨最終被雷火消滅。可見上天對董卓的憤怒是多麼強烈！

李傕和郭汜掌握了大權後，對百姓進行了殘酷的統治，並密派心腹侍奉在獻帝左右，監視他的一舉一動。獻帝此時處境艱難，朝廷官員都出於這兩個叛賊的掌控之下。為了爭取人心，他們特別宣召朱儁入朝，封他為太僕，共同執掌朝政。

一天，有人報告說西涼太守馬騰和幷州刺史韓遂率領十多萬大軍殺向長安，聲稱要討伐叛賊。原來，馬騰和韓遂曾先派人到長安與侍中馬宇、諫議大夫種邵、左中郎將劉範三人密謀策劃內應。三人秘密上奏獻帝，封馬騰為徵西將軍、韓遂為鎮西將軍，並各自接受了密詔，合力討伐叛賊。

當李傕、郭汜、張濟和樊稠得知兩軍即將到來時，他們共同商議禦敵之策。謀士賈詡建議說：“兩軍遠道而來，我們應該深挖溝壑、高築堡壘，堅守不戰。不出百日，他們的糧草就會耗盡，自然會撤退。然後我們再引兵追擊，定能擒獲馬騰和韓遂。”但李蒙和王方卻表示反對，他們認為應該主動出擊，立即斬殺馬騰和韓遂。賈詡警告他們說：“如果現在出戰，必敗無疑。”但李蒙和王方卻堅持己見，並表示如果戰敗就甘願受罰。於是賈詡建議讓張濟和樊稠屯兵在長安西二百里的盩厔山險峻之處堅守待敵，而讓李蒙和王方帶領一萬五千人馬去迎戰馬騰和韓遂的軍隊。

兩軍相遇後，馬騰和韓遂率領西涼軍擺開陣勢與李蒙和王方對峙。馬騰和韓遂大聲辱罵李蒙和王方是反賊，並問誰敢去擒拿他們。話音剛落，只見一位面如冠玉、眼若流星的少年將軍從陣中飛出，原來那就是馬騰的兒子馬超。他年僅十七歲但英勇無敵。王方見他年幼輕視於他躍馬迎戰但不到幾個回合就被馬超一槍刺於馬下身亡。馬超勒馬便回李蒙見王方已死便騎馬從馬超背後趕來想要偷襲他但馬超卻假裝不知道馬騰在陣門下大喊提醒馬超背後有人追趕但馬超卻將計就計等李蒙靠近時突然閃身躲過李蒙的一槍然後輕舒猿臂將李蒙生擒過去西涼軍士見主將被擒紛紛望風而逃馬騰和韓遂則乘勢追殺大獲全勝直逼隘口下寨並將李蒙斬首示眾。

李傕和郭汜得知李蒙和王方都被馬超所殺，才開始相信賈詡的先見之明，並重視他的計策。他們決定緊守關防，任由西涼軍挑戰，但並不出兵迎戰。果然，不出兩個月，西涼軍因為糧草匱乏而商議撤軍。然而，就在這時，長安城中的馬宇家奴出賣了家主馬宇以及劉範、種邵等人，揭露了他們與馬騰、韓遂的外聯內應計劃。李傕和郭汜大怒，將這三家的老小全部斬首示眾，並把三顆首級懸掛在城門前示眾。馬騰和韓遂見軍糧已盡，內應又被洩露，只得拔