於是盤桓於浙江一帶。期間多次參與反清戰役，直到在江浙一帶最強大的抗清勢力吳日生的軍隊兵敗後，馬士英亦遁入空門躲避清廷緝拿，後因叛徒出賣，被清廷抓獲，最終不屈就義。

令人髮指的是，東林黨不敢直接否定馬士英英勇殉國。黃宗羲等人於是便在明史上的馬士英傳裡玩了個花招，說馬士英與阮大鋮等人投降了，但清廷發現馬士英等人通敵，隨後才斬之。東林之惡毒又何止如此？弘光朝覆滅，大臣殉難的有高卓、張捷、楊維桓等，其中張捷、楊維桓是東林黨人口中所謂逆黨分子，然而二人均在南京城破時自殺殉國。尤其楊維桓，是全家老小一起死節，但是他和馬士英一樣，在闔家死難殉國後竟然被人汙衊為殺妾潛逃而遭亂兵毆打致死，馬士英死的甚為慘烈，清兵剝其皮，實之以草，時東林黨人之間有玩笑，譏諷表字為“瑤草”的馬士英之死為：“馬瑤草生懷瑤死懷草”，可見東林黨都是一幫什麼玩意了，在南京城破後，清軍統帥多鐸和寧死不降的弘光朝禮部主事黃端伯之間的一段對話頗能反映馬士英的氣節。黃端伯聽說趙之龍、錢謙益等人獻門率眾投降，在城門大書數字“大明禮部儀制司主事黃端伯不降”因而被抓捕。在審問中多鐸拍案叱喝：“你認為弘光帝是何種人物，想為他一死？”

黃端伯朗言：“皇帝聖明！”

多鐸問：“馬士英，又怎樣呢？”

黃端伯：“馬士英，忠臣也！”

多鐸又可氣又可笑，問：“馬士英乃大奸臣，何得為忠？”

黃端伯說：“馬士英不降，擁送太后入浙江，當然是忠臣。”

他指著已經剃髮易服的趙之龍等人說：“這些人才是不忠不孝之人。”

所謂南明史，就是一卷東林小丑表演的歷史畫卷，如此而已……

看到楊波陷入沉思，會議便自動轉向總結大會，這是旅順的傳統，先是各連排組織士兵開總結會，然後匯總到各營主官，他們也要總結，討論戰鬥中的各種不足和教訓等，會場裡氣氛熱烈，雷霆師打出了威風，作為各營主官面上有光，討論起來也是嗓門洪亮。

只有一個人小心的觀察著楊波，阮大鋮發現楊波臉上不時露出隱隱煞氣，偶爾咬牙切齒的樣子，彷彿在尋人而噬，阮大鋮想了想，起身朝楊波走去。

楊波從沉思中驚醒，揮手讓警惕的小五等人退開，笑著對阮大鋮道：“集之有何教我？請坐！”

說完，楊波起身恭敬的請阮大鋮在他身邊坐下，楊波的舉動讓阮大鋮心花怒放，連稱不敢，一旁有些緊張的馬士英見義兄受楊波禮待，也是暗暗高興不已。

“大人，小人有些話……”阮大鋮依照禮節先給楊波行了個禮，還沒說完便給楊波打斷了：“集之兄，這如何敢當？集之兄年長於我，我們還是平輩論交吧？”

阮大鋮心裡一沉，執意道：“大鋮投奔大人，自是大人手底一員。與大鋮平輩論交，大人莫非是嫌棄大鋮閹黨身份，不肯收容嗎？”

楊波聞言大笑道：“集之哪裡話來？瑤草大才，楊波也只能委屈他當個騎兵營軍紀官，說實話，並非楊波見外，而是暫時沒想到如何妥善安置先生罷了”

聽到楊波尊稱自己先生。知道楊波看重他，阮大鋮頓時大喜，道：“義立而王、信立而霸，大鋮只是想問問大人對此話作何想？”

楊波微微一愣，繼而大笑，湊到阮大鋮耳邊道：“先生莫非是效仿商鞅說秦孝公乎？”

阮大鋮點頭。盯著楊波的眼睛道：“非也，大鋮學問不佳，想請教大人，這秦取天下，是王道乎？是霸道乎？”

楊波想了想，認真道：“霸道”

阮大鋮又道：“霸道剛烈，始皇帝藉此六王畢，四海一。然攻守之勢相異，二世而竭，王者施仁政，霸者尚暴力，今觀