1865年春，浩罕阿力木庫爾汗派阿古柏率領50名騎兵護送布素魯克去喀什。

一到喀什，布素魯克和阿古柏便組織兵變，將司迪爾逐出喀什。 3月，司迪爾率7000餘柯爾克孜兵回襲喀什。阿古柏僅帶100名騎兵夜襲敵軍，擊潰了司迪爾，接收了司迪爾勢力的阿古柏迅速組建了數千名士兵的軍隊。 4月11日又攻克了英吉沙，並將司迪爾殘部徹底逐出新疆。

在阿古柏的扶持下，布素魯克於1865年4月建立了&ldo;哲德沙爾汗國&rdo;，意即&ldo;七城汗國&rdo;，表明了一統南疆七大城（一般認為是喀什、英吉沙、葉爾羌、和闐、阿克蘇、庫車、烏什）的野心。

1868年，英國派遣特使會晤阿古柏。

1868年，阿古柏分兩路，一路派侄子沙迪&iddot;米爾扎去阿拉木圖，到了塔什干和聖彼得堡，一路派親信穆罕默德&iddot;那扎爾赴印度旁遮普會見英國總督，爭取英國支援。英國給他贈送了一大批軍火，還允許他在印度招募工匠回喀什設立軍工廠。

同年，俄國派賴因塔爾上尉來喀什溝通， 1872年6月，俄國派人前往喀什會晤阿古柏，雙方簽訂通商條約，俄國正式承認阿古柏政權。

有了大批先進的殺傷性武器，阿古柏1870年5月攻佔了吐魯番，切斷了北疆和河西走廊的聯絡，又收降了以白彥虎為首的陝甘回民起義軍殘部，實力進一步增強。

到1871年底，迪化、瑪納斯、鄯善先後被阿古柏攻克。同時，俄國為阻止阿古柏進一步擴張，出兵佔領伊犁。這樣，清軍除塔城、烏蘇等還有少資料點外，已經全部從新疆撤出。

俄國與英國都在極力扶持這個外來政權，陰謀讓新疆&ldo;去中國化&rdo;。

1872年，俄國與阿古柏簽訂條約：俄國承認&ldo;洪福汗國&rdo;，&ldo;洪福汗國&rdo;給予俄國控制區內貿易權。

阿古柏隨即派遣阿吉托拉回訪聖彼得堡，並訪問奧斯曼帝國，身兼伊斯蘭教領袖哈里發的奧斯曼蘇丹阿卜杜勒&iddot;阿齊茲封阿古柏為&ldo;埃米爾&rdo;（意為&ldo;受命的人&rdo;，伊斯蘭教國家對上層統治者、王公、軍事長官的稱號），並派遣軍事教官去喀什噶爾，這樣阿古柏在伊斯蘭教法上就獲得了合法地位。英國維多利亞女王親筆致信阿古柏，拉攏關係。

1874年2月2日，&ldo;英阿條約&rdo;簽訂，除了&ldo;俄阿條約&rdo;內容，還規定雙方互派大使。

新疆160多萬平方公里的領土，因為阿古柏這個外來入侵政權邁出脫離中國的第一步，變得岌岌可危；如果再朝前邁出一步，就要被俄國與英國聯合起來瓜分。

東南沿海與西北邊陲同時遇此大難，清廷該怎麼做？

在慈禧太后表態之前，要看左宗棠與李鴻章想怎麼做。

李鴻章搶先發表了他對新疆問題的全面看法。

1874年12月10日，李鴻章寫了一本長達九千字的《籌議海防折》。在這篇洋洋灑灑的文章中，李鴻章系統提出並論證了&ldo;放棄新疆、專務海防&rdo;的主張。

新疆本來是中國的領土，為什麼要抓緊時間送給別國呢？李鴻章說出自己的理由。

第一，新疆土地貧瘠，難以開發，如果不送給別國，這塊百無一用的土地，不但不能幫中國賺錢，反而消耗掉國家大把的錢。李鴻章提筆這樣表達：&ldo;而且新疆各城，自乾隆年間始歸版圖。無論開闢之難，即無事時，歲需兵費三百餘萬，徒收數千里之曠地，而增千百年之卮漏，已為不值。&rdo;

第二，新疆鄰居