小智一行人與芽衣透子兩人意外在野外相遇，並決定一起前往飛雲市，在這途中也就是前往飛雲市的天之箭橋上，眾人幫助一隻哥德小姐與莎麗小姐重逢。 她們這超越時間的友誼，讓眾人很是感動，只不過眾人不知道的是，今天晚上在飛雲市不遠處的荒野名勝區，火箭隊也開始了他們的行動。 危機正悄然接近！ —————————— 飛雲市！ 合眾地區的最大的城市，也是核心城市，摩天大樓比比皆是，十分壯觀！ 而最吸引人的莫過於這裡的特產——飛雲冰淇淋，不僅美味，而且還擁有治癒神奇寶貝異常狀態的功能。 “飛雲市真的好大哦！”艾莉絲頓時驚呼起來，牙牙也是露出頭來，歡呼雀躍的叫了起來。 “對了，我聽說這裡有非常好吃的飛雲冰淇淋哦，我一定要去吃吃看！”天桐笑著提議道。 “好呀，好呀！在進行道館之前先嚐嘗飛雲冰淇淋吧！”接著艾莉絲疑惑的四處觀望道，“奇怪，芽衣和透子跑哪裡去了？” 剛進入飛雲市，這兩個小姑娘就跑沒影了，等了一會兒，就當小智一行人準備讓胡帕將她們兩個找回來的時候，小智突然笑道，“她們來了！” 天桐、艾莉絲以及拉帝亞斯它們順著小智的目光看去，果不其然就看到了，芽衣正拿著兩個飛雲冰淇淋向小智一行人跑來，“小智哥，快嚐嚐這冰淇淋。” 說著，將手上的一支冰淇淋遞給了小智，這讓其他人見狀很是羨慕，畢竟他們也很想吃冰淇淋。 “哎呀～” 突然透子出現在了其身後，一拳就落在了芽衣的腦袋上，“你亂跑什麼？剛進飛雲市就向著飛雲冰淇淋的店鋪跑去，現在又率先溜了回來！” “對了，這是你們的飛雲冰淇淋！”透子連忙從空間揹包中拿出了打包好的飛雲冰淇淋，一一分發了下去。 “哦耶！太好了，是飛雲冰淇淋！”艾莉絲率先歡呼了起來，畢竟她可惦記好久。 “謝謝！”天桐很有禮貌的道歉一聲。 而拉帝亞斯、胡帕、皮卡丘、伊布以及牙牙也紛紛拿著一個飛雲冰淇淋?了起來。 “略略略～”芽衣拉下一個眼皮，對透子吐了吐小香丁，然後就慢慢地對她的冰淇淋?了起來，很是俏皮可愛！ 對此，小智與透子無奈的搖了搖頭，低頭品嚐起了這美味的飛雲冰淇淋。 吃完冰淇淋，小智一行人便向著飛雲道館的方向前進，至於逛逛飛雲市只能向後放一放，畢竟這種大都市就是逛上兩天兩夜也逛不完，還不如先拿下徽章，就有的是時間逛！ 只是走在路上，小智忍不住皺起了眉頭，他總是有種說不上來的奇怪感覺，彷彿在預示著即將發生巨大事故！ 就在眾人穿過城市的花園，正巧碰到了爬在樹上的道館訓練家——亞堤，他正在觀察樹上的蟲神奇寶貝！ “亞堤先生！”小智率先上前打了聲招呼，“是不是發生什麼事了？” 亞堤先生聞言頓時警惕了起，他知道小智是個超能力者，再結合他的觀察，當即嚴肅道，“從昨晚開始，蟲系神奇寶貝好像察覺到了什麼，一直很焦躁不安！” “我聽說當大災難來臨的時候，蟲系神奇寶貝就會開始焦躁！”艾莉絲頓時驚呼道。 亞堤先生沉重的點點頭，“是啊，蟲系神奇寶貝具有感應到人類無法察覺到的電磁波等現象的能力，這在科學上也已經被證實了！” 小智頓時明白這次事件絕對不簡單，當即全力使用波導之力感應了起來，睜開雙眼小智嚴肅道，“地下有大量的波導正在移動！” “什麼？！”亞提先生聞言頓時大驚，“該不會是地下水道吧？而且那裡一直連線到前邊荒野裡的河流！” “等一下，這麼說來，以前住在荒野裡的神奇寶貝也曾經透過這個地下水道遷移到這裡來呢！”亞堤先生此刻也意識到了什麼，不出意外的話，應該是荒野名勝區那邊出了問題。 “胡帕帶我們去地下水道！” 小智的話音剛落下，胡帕就毫不猶豫的丟出了圓環，眾人毫不猶豫的穿越圓環來到了地下水道，在小智的指引下，向著波導匯聚的方向趕了過去。 結果前進沒多久，就看到了一隻百足蜈