了加強邊防的戰略建議，顯示出他對國家安全的關注。

光緒六年（1880年），由於舊疾復發，曾國荃再次請辭並獲得批准休養。不過，很快他就又被召回京城，並在同年六月被派往山海關督辦防務，應對日益緊張的中俄關系。儘管身體狀況不佳，曾國荃依然盡職盡責地完成了任務，並受到了朝廷的高度讚揚。

光緒七年（1881年）二月一日，曾國荃被補授陝甘總督兼兵部尚書銜，但由於健康問題未能立即赴任。此後不久，他又被任命為兩廣總督，當時正值中法之間因越南問題關係緊張，戰爭一觸即發。身處前線的曾國荃採取了相對保守的態度，主張避免直接衝突，保持和平狀態。他認為廣東軍隊不應主動出擊，而是要隱秘地展示軍事準備的姿態。

光緒九年（1883年）七月，曾國荃卸任兩廣總督，並前往北京覲見。慈禧太后特別詢問了有關法國和越南局勢的情況。同年十一月十九日，他獲得了“紫禁城內騎馬”的特殊待遇，顯示了他在朝廷中的地位。

到了光緒十年（1884年），曾國荃先是署理禮部尚書，隨後不久便被調任兩江總督兼辦理通商事務大臣。同年夏天，隨著中法戰爭爆發，他被任命為全權大臣，前往上海與法國駐華公使巴德諾進行談判。然而，在談判過程中，曾國荃的表現被認為不夠強硬且缺乏技巧，他自己也承認不擅長這種外交交涉。最終，在李鴻章的建議下，他擅自答應給予法國五十萬兩白銀作為“撫卹金”，但這個數額遠遠低於法國方面的期望，被視為“笑柄”。此事不僅沒有解決爭端，反而讓曾國荃受到了朝廷的嚴厲批評，整個談判以失敗告終。

中法戰爭爆發後，法國軍隊開始侵擾中國沿海地區，朝廷內部對於是和是戰爭論不休。在這個關鍵時刻，曾國荃被委以重任，負責整治長江及海上防務。面對複雜的局勢，他採取了謹慎的態度，利用上海作為國際商貿中心的地位，試圖透過外交手段來緩和緊張局勢，避免直接與法軍發生衝突。同時，他也加強了軍事部署，確保一旦戰爭爆發能夠迅速應對。

在這一時期，朝廷派遣文臣前往沿海各省協助處理軍務，這導致了一些省份的地方官員難以完全掌控兵權。對此，曾國荃向朝廷進言，強調權力不能分散，必須集中指揮才能有效應對危機。由於他是久經沙場的老將，朝廷對他格外倚重，並採納了他的建議。

隨後，朝廷命令曾國荃派遣兵艦支援臺灣，以抵禦可能的法軍入侵。雖然曾國荃承諾派出五艘兵艦，但實際上只派出了三艘。這種做法引起了朝廷的不滿，最終他因此受到了“革職留任”的處分。然而，即使如此，派出的兵艦也未能抵達臺灣，其中兩艘甚至返回到了浙江海域，並參與了鎮海戰役，取得了顯著戰功。隨著中法兩國迅速達成和平協議，這場短暫而激烈的戰爭終於告一段落。

光緒十一年（1885年），朝廷進行了京察（即對官員進行考核），鑑於曾國荃過去的功勳，僅對其進行了輕微的處分——開復處分，這意味著他的職務得以恢復，但之前的處罰記錄仍然存在。此後，曾國荃繼續擔任要職，並在光緒十四年（1888年）成功平定了合肥西鄉劉文弼領導的一次起義，再次證明了自己的軍事才能。

到了光緒十五年（1889年），慈禧太后宣佈歸政於光緒帝，為了表彰曾國荃多年的貢獻，特授予他太子太保的頭銜。這個榮譽不僅是對他個人能力的認可，也是對其家族忠誠服務的一種肯定。

在治理兩江地區的六年時間裡，曾國荃展現出了卓越的管理才能。據《清史稿》記載，他善於把握大局，不過分糾結於瑣碎事務，使得該地區軍民關係和諧穩定。在他的領導下，兩江地區的經濟和社會秩序得到了有效的維護和發展。這種治績不僅贏得了當地民眾的支援，也為他在朝中的地位增