朝廷任命勝保為欽差大臣，負責統籌安徽、河南兩地的剿匪工作，並要求李續宜協助執行相關任務。但很快人們發現，勝保似乎更傾向於透過招撫而非武力手段解決問題，尤其是對待苗沛霖這樣的地方武裝力量時更是如此。對此，李續宜持有不同意見，他認為應當堅決打擊那些反覆無常的叛亂分子，以徹底消除隱患。為此，他還向朝廷提出了具體的策略建議，即“寬其黨羽，使為我用，彼勢孤，終成擒耳”。

基於李續宜提出的合理方案，加上對勝保行為模式的擔憂，清廷最終決定於六月份將後者調往陝西任職，並賦予李續宜全權處理淮北地區的剿捻事務。此外，他還被授予欽差大臣頭銜，專門負責督辦安徽全省的軍務工作。

四、壯年早逝

李續宜在擔任欽差大臣不久後，遭遇了人生中的一大打擊——他的母親病逝。根據當時的社會風俗，作為孝子的李續宜理應回家守孝三年。然而，當時安徽的軍事形勢異常緊張，清廷不願輕易失去這樣一位有能力的將領。於是，朝廷做出了一個艱難的決定，即“破格奪情”，命令李續宜在軍營中穿孝服百日，以臨時代理的身份繼續擔任安徽巡撫。面對這一命令，李續宜內心充滿了矛盾，他一方面深知自己肩負著國家重任，另一方面也渴望能夠回到家中為母親盡孝。

儘管朝廷一再強調“安徽軍情吃緊”，但李續宜仍舊堅持己見，連續上書請求回籍奔喪。最終，清廷妥協，准許他請假百日，返回家鄉辦理喪事。然而，正當李續宜準備結束假期重返工作崗位之際，他的健康狀況卻出現了惡化，長期積勞成疾導致他開始咳血，身體每況愈下。出於對自己身體狀況的考慮，李續宜選擇了留在家鄉休養，未能如期回到安徽赴任。

同治二年（1863年）四月，清廷再度下達命令，要求李續宜與蒙古王公僧格林沁合作，共同對付壽州的苗沛霖。然而，李續宜的身體狀況已經不允許他繼續參與前線作戰。在前往指定地點的途中，他的病情急劇加重，不得不再次向朝廷提出辭職請求，希望解除巡撫的職務。這一次，出於對其健康狀況的理解，清廷批准了他的申請，允許他離職療養。

然而，命運似乎並不打算給他更多的時間。同年十月，李續宜最終因病在湖南湘鄉的家中逝世，享年僅四十一歲。他的突然離世不僅令家人悲痛欲絕，也讓朝廷失去了一個重要的軍事人才。清廷對於李續宜的去世表達了深切哀悼，並按照“總督軍營病故”的禮儀規格為其舉行了隆重的葬禮。此外，為了紀念這位為國捐軀的忠臣，朝廷還特別下令在李續宜曾經立下汗馬功勞的地方——長沙、武昌、安慶以及寶慶等地設立專祠，供後人瞻仰祭奠。而在他的原籍湘鄉，同樣建立了祠堂以示敬意。