鎮壓了馬其頓貴族的謀叛，然後率軍南下，越過溫泉關，進入福基斯，在特爾斐召開近鄰同盟會議，重掌腓力時代盟主的大權。接著，他進軍伯羅奔尼撒，控制了斯巴達以外的各邦。雅典雖然沒有直接受到亞歷山大的軍事打擊，但也因懼怕其強大的軍事力量，不得不派使節向亞歷山大請罪，承認他為希臘的霸主。

前336年秋，亞歷山大在科林斯召開希臘同盟大會，除斯巴達外各邦皆有代表參加。會上，亞歷山大被任命為反對波斯的聯盟統帥，領導對波斯的復仇戰爭。然而，亞歷山大並沒有立即發動對波斯的進攻，他認為在進軍之前，必須掃蕩北部和西部，清除前進路上的障礙，確保後方基地馬其頓的安全。

前335年，亞歷山大親自率軍出征馬其頓北部的色雷斯，為東征小亞細亞穩固北部防線，並報復前338年當地特里巴利部落對腓力二世部隊的偷襲和戰利品的盜竊。在多瑙河打敗特里巴利後，亞歷山大繼續進軍，打敗了威脅馬其頓西北的伊利里亞人。然而，就在亞歷山大在北方征戰之際，希臘各邦誤傳他已在多瑙河戰場陣亡。底比斯率先起事，殺死留駐的馬其頓官員，圍攻駐紮在衛城卡德米亞的馬其頓軍。雅典和伯羅奔尼撒各邦也加入了反馬其頓運動，但態度較為謹慎。

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亞歷山大聞訊後，迅速從伊利里亞趕回，僅用了14天便抵達底比斯。底比斯的抵抗迅速失敗，城市被徹底摧毀。亞歷山大將底比斯的國土分給盟友，並將大部分底比斯居民賣為奴隸，只有神廟和詩人品達的住所幸免於難。港口被封鎖的雅典隨後也放棄了抵抗，希臘各邦紛紛派使節向亞歷山大謝罪。不到兩年的時間，亞歷山大就穩固了他在希臘的地位。在科林斯召開的希臘同盟大會上，各邦重申擁立亞歷山大為希臘盟主，支援他東征波斯。儘管在亞歷山大東征期間，希臘各邦仍有反馬其頓的運動，但均未能成功。

三、初戰告捷

前334年，亞歷山大以馬其頓和希臘聯軍最高統帥的身份，出征小亞細亞，標誌著他東征波斯的開始。這次遠征不僅是為了報父仇，更是為了“解放”小亞細亞的希臘城邦，以及滿足馬其頓貴族和希臘奴隸主從戰爭中掠奪領土、財富和奴隸的慾望。亞歷山大帶著由馬其頓和其他希臘城邦組成的約30,000至40,000步兵和4,000至5,000騎兵，以及160艘戰艦，渡過了希裡帕（今達達尼爾海峽）。儘管國庫空虛，他只帶了30天的補給，但這並未阻擋他的決心。

亞歷山大首先訪問了特洛伊，與將軍帕曼紐帶領的其餘部隊會合，繼續向波斯地方總督的要塞進軍。附近的兩個希臘城市已經獨立於波斯，不希望被“解放”，而亞歷山大的部隊急需透過征服得到補給。波斯的希臘僱傭軍統帥、羅德斯的蒙農建議焚燒周邊的田地，但波斯地方總督出於對財產的憐惜，未採納這一建議。

波斯邊疆省份的三位總督，包括波斯國王大流士三世的駙馬，聯兵4萬人（其中2萬波斯騎兵，2萬希臘僱傭兵）在馬爾馬拉海南岸的格拉尼庫斯河與亞歷山大正面交戰。這是亞歷山大和波斯軍隊的第一次交鋒。波斯軍佔據格拉尼庫斯河右岸高地，嚴陣以待。亞歷山大不顧軍隊長途跋涉的疲勞，親率近衛部隊“夥友騎兵”強行渡河，與波斯騎兵交戰。在戰鬥中，亞歷山大表現出非凡的勇氣，他的頭盔和帽纓甚至被一位波斯總督的戰斧劈掉。然而，亞歷山大的勇敢和指揮才能使他迅速扭轉了局勢。波斯軍潰敗，兩位總督被殺死，2000多人被俘（多為希臘僱傭兵）。

為了恐嚇為波斯人效勞的希臘僱傭兵，亞歷山大在戰場上屠殺了大部分希臘僱傭兵，其餘被押回馬其頓強迫勞動。他還將300領波斯鎧甲作為給雅典娜的祭品送回雅典衛城，題字曰：“來自亞歷山大，腓力之子，和希臘人（除了斯巴