天聰五年（1631年），皇太極仿照明朝制度設立了六部，阿巴泰被任命為工部的負責人。然而，他並不擅長處理繁雜的行政事務，這使得他在工部的工作表現不佳。皇太極對他的表現表示失望，並對其進行了批評。

天聰七年（1633年），阿巴泰奉命修築蘭磐城，並得到了皇太極的賞賜。同年，他率軍攻打山海關，雖然俘獲了數千人，但未能深入明境，這也受到了皇太極的責備。

天聰八年（1634年），阿巴泰跟隨皇太極出征宣府，到達應州後，攻克了靈丘和王家莊兩地。這一系列的軍事行動進一步彰顯了他的軍事才能，併為清朝的擴張做出了重要貢獻。

三、倍受冷落

崇德元年（1636年）四月，皇太極稱帝並改元崇德，對宗室進行了大規模的封賞。在這個過程中，阿巴泰雖然被封為多羅饒餘貝勒，但並未得到與其他幼弟如多爾袞、多鐸一樣的親王封號，這讓阿巴泰感到頗為不滿。這種不滿的情緒隨著時間的推移而累積，阿巴泰對於皇太極始終未能給予他更高的爵位感到不悅。儘管如此，他仍舊在戰場上發揮著重要作用。

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六月，阿巴泰同武英郡王阿濟格等徵明，攻克了一系列的堡壘和城市，包括鵰鶚堡、長安嶺堡，並逼近延慶州。他們先後攻克了定興、安肅、容城、安州、雄縣、東安、文安、寶坻、順義、昌平等地，共經歷了五十六次戰鬥，均取得了勝利。在這次戰役中，他們還生擒了總兵巢丕昌等人，並派遣都統譚泰等設伏，斬殺了遵化三屯營的守將。清軍出關時，還殲滅了在後面追擊的明軍，繳獲了一百四十餘匹馬。捷報傳來後，皇太極下令嘉獎阿巴泰，賜予他兩匹馬。九月，阿巴泰凱旋而歸，皇太極親自迎接。

十二月，皇太極親征朝鮮，命令阿巴泰駐守噶海城，負責收集邊民以防備敵軍。次年二月，朝鮮投降，阿巴泰帶領駐守在噶海城的軍隊返回瀋陽。

崇德三年（1638年），皇太極討伐喀爾喀，阿巴泰與禮親王代善留守。期間，阿巴泰修築了遼陽都爾弼城，並再次疏通了盛京至遼河的道路。多爾袞率軍攻打明朝，以阿巴泰為副將，從長城口進入，越過北京，趨近涿州，直抵山西。之後，又向東直至山東臨清，攻克了濟南，並攻打天津、遷安等地，出兵青山關後退軍。回到盛京後，阿巴泰被賞賜兩匹馬和五千兩白銀。

崇德四年（1639年），阿巴泰偕同阿濟格攻打錦州、寧遠。次年，即崇德五年（1640年），阿巴泰偕同多爾袞在義州屯田，並分兵攻克了錦州城西九臺，收割了稻禾；又攻克了小淩河西二臺。他還攜同杜度設伏兵於寧遠，截斷明軍的運輸路線，奪取了大量糧食。之後，他又轉移兵力打敗了明軍在杏山、松山的兵馬。這一時期，清軍頻繁圍攻錦州，阿巴泰多次在松錦之間來回行軍。

崇德六年（1641年），阿巴泰因跟隨多爾袞在距離錦州三十里的地方紮營，以及派遣士卒私自回家等罪過，論罪削爵，剝奪了他的一部分屬民。然而，皇太極下詔寬恕了他，只罰了他兩千兩銀子。同年，阿巴泰跟隨皇太極大破洪承疇率領的十三萬明軍援兵，獲得了五百七十匹馬，並殲滅了數萬敵軍。

崇德七年（1642年），錦州投降後，阿巴泰偕同濟爾哈朗圍攻杏山，攻克後繼續守衛錦州。在論功行賞時，他被賞賜了七十匹蟒緞。同年十月，阿巴泰獲授奉命大將軍，率軍討伐明朝，內大臣圖爾格為副將。他們自黃崖口進入明朝邊境，在薊州打敗了明總兵白騰蛟、白廣恩等人，並連續攻破河間、景州等地。他們趨近兗州，擒斬了明魯王朱以派及樂陵、陽信、東原、安邱、滋陽諸王。分兵攻打萊州、登州、青州、莒州、沂州等地，一直打到海州。回軍時，他們還攻打河北滄州、天津、三河、密雲等地。此役，他